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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
18/12/2017 |
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Data da última atualização: |
18/12/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BELESINI, A. A.; CARVALHO, F. M. S.; TELLES, B. R.; CASTRO, G. M. de; GIACHETTO, P. F.; VANTINI, J. S.; CARLIN, S. D.; CAZETTA, J. O.; PINHEIRO, D. G.; FERRO, M. I. T. |
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Afiliação: |
FCAV/Unesp; FCAV/Unesp; FCAV/Unesp; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; FCAV/Unesp; Centro Avançado da Pesquisa Tecnológica do Agronegócio de Cana, Ribeirão Preto, SP; FCAV/Unesp; FCAV/Unesp; FCAV/Unesp. |
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Título: |
De novo transcriptome assembly of sugarcane leaves submitted to prolonged water-deficit stress. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 16, n. 2, p. 1-20, 2017. |
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DOI: |
http://dx.doi.org/10.4238/gmr16028845 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Article gmr16028845. |
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Conteúdo: |
ABSTRACT. Sugarcane production is strongly influenced by drought, which is a limiting factor for agricultural productivity in the world. In this study, the gene expression profiles obtained by de novo assembly of the leaf transcriptome of two sugarcane cultivars that differ in their physiological response to water deficit were evaluated by the RNA-Seq method: drought-tolerant cultivar (SP81-3250) and drought-sensitive cultivar (RB855453). For this purpose, plants were grown in a greenhouse for 60 days and were then submitted to three treatments: control (-0.01 to -0.015 MPa), moderate water deficit (-0.05 to -0.055 MPa), and severe water deficit (-0.075 to -0.08 MPa). The plants were evaluated 30, 60, and 90 days after the beginning of treatment. Sequencing on an Illumina platform (RNA-Seq) generated more than one billion sequences, resulting in 177,509 and 185,153 transcripts for the tolerant and sensitive cultivar, respectively. These transcripts were aligned with sequences from Saccharum spp, Sorghum bicolor, Miscanthus giganteus, and Arabidopsis thaliana available in public databases. The differentially expressed genes detected during the prolonged period of water deficit permit to increase our understanding of the molecular patterns involved in the physiological response of the two cultivars. The tolerant cultivar differentially expressed a larger number of genes at 90 days, while in the sensitive cultivar the number of differentially expressed genes was higher in 30 days. Both cultivars perceived the lack of water, but the tolerant cultivar responded more slowly than the sensitive cultivar. The latter requires rapid activation of different water-deficit stress response mechanisms for its survival. This rapid activation of metabolic pathways in response to water stress does not appear to be the key mechanism of drought tolerance in sugarcane. There is still much to clarify on the molecular and physiological pattern of plants in response to drought. MenosABSTRACT. Sugarcane production is strongly influenced by drought, which is a limiting factor for agricultural productivity in the world. In this study, the gene expression profiles obtained by de novo assembly of the leaf transcriptome of two sugarcane cultivars that differ in their physiological response to water deficit were evaluated by the RNA-Seq method: drought-tolerant cultivar (SP81-3250) and drought-sensitive cultivar (RB855453). For this purpose, plants were grown in a greenhouse for 60 days and were then submitted to three treatments: control (-0.01 to -0.015 MPa), moderate water deficit (-0.05 to -0.055 MPa), and severe water deficit (-0.075 to -0.08 MPa). The plants were evaluated 30, 60, and 90 days after the beginning of treatment. Sequencing on an Illumina platform (RNA-Seq) generated more than one billion sequences, resulting in 177,509 and 185,153 transcripts for the tolerant and sensitive cultivar, respectively. These transcripts were aligned with sequences from Saccharum spp, Sorghum bicolor, Miscanthus giganteus, and Arabidopsis thaliana available in public databases. The differentially expressed genes detected during the prolonged period of water deficit permit to increase our understanding of the molecular patterns involved in the physiological response of the two cultivars. The tolerant cultivar differentially expressed a larger number of genes at 90 days, while in the sensitive cultivar the number of differentially expressed genes was higher in 30 da... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Expressão genética. |
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Thesagro: |
Cana de açúcar; Deficiência hídrica. |
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Thesaurus Nal: |
Drought; Gene expression; Saccharum; Sugarcane; Water stress. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/169187/1/AP-Denovo-Belesini-gmr.pdf
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Marc: |
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520 $aABSTRACT. Sugarcane production is strongly influenced by drought, which is a limiting factor for agricultural productivity in the world. In this study, the gene expression profiles obtained by de novo assembly of the leaf transcriptome of two sugarcane cultivars that differ in their physiological response to water deficit were evaluated by the RNA-Seq method: drought-tolerant cultivar (SP81-3250) and drought-sensitive cultivar (RB855453). For this purpose, plants were grown in a greenhouse for 60 days and were then submitted to three treatments: control (-0.01 to -0.015 MPa), moderate water deficit (-0.05 to -0.055 MPa), and severe water deficit (-0.075 to -0.08 MPa). The plants were evaluated 30, 60, and 90 days after the beginning of treatment. Sequencing on an Illumina platform (RNA-Seq) generated more than one billion sequences, resulting in 177,509 and 185,153 transcripts for the tolerant and sensitive cultivar, respectively. These transcripts were aligned with sequences from Saccharum spp, Sorghum bicolor, Miscanthus giganteus, and Arabidopsis thaliana available in public databases. The differentially expressed genes detected during the prolonged period of water deficit permit to increase our understanding of the molecular patterns involved in the physiological response of the two cultivars. The tolerant cultivar differentially expressed a larger number of genes at 90 days, while in the sensitive cultivar the number of differentially expressed genes was higher in 30 days. Both cultivars perceived the lack of water, but the tolerant cultivar responded more slowly than the sensitive cultivar. The latter requires rapid activation of different water-deficit stress response mechanisms for its survival. This rapid activation of metabolic pathways in response to water stress does not appear to be the key mechanism of drought tolerance in sugarcane. There is still much to clarify on the molecular and physiological pattern of plants in response to drought.
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650 $aGene expression
650 $aSaccharum
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650 $aDeficiência hídrica
653 $aExpressão genética
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700 1 $aTELLES, B. R.
700 1 $aCASTRO, G. M. de
700 1 $aGIACHETTO, P. F.
700 1 $aVANTINI, J. S.
700 1 $aCARLIN, S. D.
700 1 $aCAZETTA, J. O.
700 1 $aPINHEIRO, D. G.
700 1 $aFERRO, M. I. T.
773 $tGenetics and Molecular Research, Ribeirão Preto$gv. 16, n. 2, p. 1-20, 2017.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Soja; Embrapa Trigo. |
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Data corrente: |
18/09/2015 |
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Data da última atualização: |
18/03/2016 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
SILVA, W. T. da; KARAM, D.; VARGAS, L.; GAZZIERO, D. L. P.; GOMES, T. C. |
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Afiliação: |
WILTON TAVARES DA SILVA, UFSJ, Sete Lagoas, MG.; DECIO KARAM, CNPMS; LEANDRO VARGAS, CNPT; DIONISIO LUIZ PISA GAZZIERO, CNPSO; TALITA CAMARGOS GOMES, UFSJ, Campus de Sete Lagoas, MG. |
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Título: |
Estudo fitossociológico de plantas daninhas nas culturas de milho e soja em Goiás. |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESO LATINOAMERICANO DE MALEZAS, 22.; CONGRESO ARGENTINO DE MALEZAS, 1., 2015, Buenos Aires. Ciencia e producción: hacia un manejo nacional: trabajos científicos. Buenos Aires: Asociación Argentina de Ciencia de las Malezas: Asociación Latinoamericana de Malezas, 2015. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
RESUMO: A caracterização e o levantamento de espécies de plantas daninhas permite a identificação, quantificação, além de auxiliar na tomada de decisão do controle. Com objetivo de fazer o levantamento floristico de plantas daninhas em áreas de produção de milho e soja no estado de Goiás (Anicuns, Catalão, Goiânia, Meia Ponte, Pires do Rio, Quirinópolis, Sudoeste de Goiás e Vale do Rio dos Bois), foi conduzido no ano agrícola 2013/14 amostragens, para a identificação e contagem das plantas em cada área de estudo. As amostragens foram feitas, após as aplicações dos herbicidas de pós-emergência, usando um quadro, lançado aleatoriamente nas áreas de produção de milho e soja. Após a identificação e contagem das plantas daninhas foi realizado o estudo fitossociológico das espécies e famílias anotadas. Neste levantamento foram identificadas 41 espécies classificadas em 14 famílias. Richardia brasiliensis, Chamaesyce hirta, Digitaria sp., Commelina benghalensis, Urochloa sp. e Conyza sp foram as espécies que apresentaram o maior valor de importância calculado. ABSTRACT: The weed survey allows the correct identification and quantification to support the decisionmaking control. The weed survey was carried out (516 samples) in 8 Goiás regions (Anicuns, Catalão, Goiânia, Meia Ponte, Pires do Rio, Quirinópolis, Sudoeste de Goiás e Vale do Rio dos Bois) in a corn and soybean production areas during 2013/14. The survey was conducted on the weed populations occurring after post-emergence herbicides application. Weeds were identified and quantified according to the inventory square method (0,5 x 0,5 m). Frequency, relative frequency, density, relative density, abundance, relative abundance and importance value index were estimated. A total of 41 weed species were identified into 14 families. Richardia brasiliensis, Chamaesyce hirta, Digitaria sp., Commelina benghalensis, Urochloa sp. e Conyza sp showed the higher importance value index. MenosRESUMO: A caracterização e o levantamento de espécies de plantas daninhas permite a identificação, quantificação, além de auxiliar na tomada de decisão do controle. Com objetivo de fazer o levantamento floristico de plantas daninhas em áreas de produção de milho e soja no estado de Goiás (Anicuns, Catalão, Goiânia, Meia Ponte, Pires do Rio, Quirinópolis, Sudoeste de Goiás e Vale do Rio dos Bois), foi conduzido no ano agrícola 2013/14 amostragens, para a identificação e contagem das plantas em cada área de estudo. As amostragens foram feitas, após as aplicações dos herbicidas de pós-emergência, usando um quadro, lançado aleatoriamente nas áreas de produção de milho e soja. Após a identificação e contagem das plantas daninhas foi realizado o estudo fitossociológico das espécies e famílias anotadas. Neste levantamento foram identificadas 41 espécies classificadas em 14 famílias. Richardia brasiliensis, Chamaesyce hirta, Digitaria sp., Commelina benghalensis, Urochloa sp. e Conyza sp foram as espécies que apresentaram o maior valor de importância calculado. ABSTRACT: The weed survey allows the correct identification and quantification to support the decisionmaking control. The weed survey was carried out (516 samples) in 8 Goiás regions (Anicuns, Catalão, Goiânia, Meia Ponte, Pires do Rio, Quirinópolis, Sudoeste de Goiás e Vale do Rio dos Bois) in a corn and soybean production areas during 2013/14. The survey was conducted on the weed populations occurring after post-emergence h... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Chamaesyce hirta; Conyza sp; Digitaria insularis; Fitossociologia; Phytossocioloy; Planta daninha. |
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Thesagro: |
Euphorbia Heterophylla. |
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Thesaurus NAL: |
Conyza; Euphorbia hirta. |
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Categoria do assunto: |
--
H Saúde e Patologia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/129939/1/Estudo-fitossociologico-1.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/130196/1/ID-43212-2015malezasBE.EP.57.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/139965/1/estudo-fitossociologico.gazziero.2015.pdf
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Marc: |
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100 1 $aSILVA, W. T. da
245 $aEstudo fitossociológico de plantas daninhas nas culturas de milho e soja em Goiás.$h[electronic resource]
260 $aIn: CONGRESO LATINOAMERICANO DE MALEZAS, 22.; CONGRESO ARGENTINO DE MALEZAS, 1., 2015, Buenos Aires. Ciencia e producción: hacia un manejo nacional: trabajos científicos. Buenos Aires: Asociación Argentina de Ciencia de las Malezas: Asociación Latinoamericana de Malezas$c2015
520 $aRESUMO: A caracterização e o levantamento de espécies de plantas daninhas permite a identificação, quantificação, além de auxiliar na tomada de decisão do controle. Com objetivo de fazer o levantamento floristico de plantas daninhas em áreas de produção de milho e soja no estado de Goiás (Anicuns, Catalão, Goiânia, Meia Ponte, Pires do Rio, Quirinópolis, Sudoeste de Goiás e Vale do Rio dos Bois), foi conduzido no ano agrícola 2013/14 amostragens, para a identificação e contagem das plantas em cada área de estudo. As amostragens foram feitas, após as aplicações dos herbicidas de pós-emergência, usando um quadro, lançado aleatoriamente nas áreas de produção de milho e soja. Após a identificação e contagem das plantas daninhas foi realizado o estudo fitossociológico das espécies e famílias anotadas. Neste levantamento foram identificadas 41 espécies classificadas em 14 famílias. Richardia brasiliensis, Chamaesyce hirta, Digitaria sp., Commelina benghalensis, Urochloa sp. e Conyza sp foram as espécies que apresentaram o maior valor de importância calculado. ABSTRACT: The weed survey allows the correct identification and quantification to support the decisionmaking control. The weed survey was carried out (516 samples) in 8 Goiás regions (Anicuns, Catalão, Goiânia, Meia Ponte, Pires do Rio, Quirinópolis, Sudoeste de Goiás e Vale do Rio dos Bois) in a corn and soybean production areas during 2013/14. The survey was conducted on the weed populations occurring after post-emergence herbicides application. Weeds were identified and quantified according to the inventory square method (0,5 x 0,5 m). Frequency, relative frequency, density, relative density, abundance, relative abundance and importance value index were estimated. A total of 41 weed species were identified into 14 families. Richardia brasiliensis, Chamaesyce hirta, Digitaria sp., Commelina benghalensis, Urochloa sp. e Conyza sp showed the higher importance value index.
650 $aConyza
650 $aEuphorbia hirta
650 $aEuphorbia Heterophylla
653 $aChamaesyce hirta
653 $aConyza sp
653 $aDigitaria insularis
653 $aFitossociologia
653 $aPhytossocioloy
653 $aPlanta daninha
700 1 $aKARAM, D.
700 1 $aVARGAS, L.
700 1 $aGAZZIERO, D. L. P.
700 1 $aGOMES, T. C.
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Esconder MarcMostrar Marc Completo |
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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